Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms