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| RUNX3 | Q13761 | AL845331.3-202 | ENST00000562856 | 261 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR544B-201 | ENST00000582372 | 78 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL353997.4-201 | ENST00000586196 | 166 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC027514.2-201 | ENST00000591014 | 637 nt | TSL 3 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF28-207 | ENST00000594602 | 684 nt | TSL 5 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BBIP1P1-201 | ENST00000602999 | 279 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BCRP9-201 | ENST00000605312 | 388 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC013412.1-201 | ENST00000610687 | 192 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC006927.3-201 | ENST00000638789 | 384 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NBEAL1-203 | ENST00000449802 | 10938 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KNTC1-205 | ENST00000450485 | 3655 nt | TSL 2 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF33BP1-201 | ENST00000452497 | 1834 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TBC1D15-210 | ENST00000485960 | 2489 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NOC3L-201 | ENST00000371361 | 3455 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCFD1-207 | ENST00000544052 | 2058 nt | TSL 2 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SYNE1-212 | ENST00000423061 | 27436 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPA17-201 | ENST00000227135 | 853 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-28P-201 | ENST00000362378 | 107 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP258-201 | ENST00000362750 | 119 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-112P-201 | ENST00000364401 | 164 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-24P-201 | ENST00000364565 | 139 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-837P-201 | ENST00000391056 | 108 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC098826.1-201 | ENST00000433943 | 471 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | GDI2P2-201 | ENST00000445131 | 608 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | MTND4LP3-201 | ENST00000468320 | 276 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL442P-201 | ENST00000473804 | 320 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC093297.2-207 | ENST00000505401 | 692 nt | TSL 3 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01335-201 | ENST00000507890 | 389 nt | TSL 3 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC117522.3-201 | ENST00000507974 | 584 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008892.1-201 | ENST00000511861 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018437.2-201 | ENST00000517369 | 389 nt | TSL 5 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNHG6-202 | ENST00000520619 | 479 nt | TSL 3 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TUG1-202 | ENST00000521091 | 2110 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR4P1P-201 | ENST00000530808 | 1136 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009558.1-201 | ENST00000561174 | 581 nt | TSL 4 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02164-201 | ENST00000566684 | 272 nt | TSL 3 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157938.2-203 | ENST00000589540 | 931 nt | TSL 5 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC119751.7-201 | ENST00000600494 | 245 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC146944.4-201 | ENST00000602697 | 718 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000403.1-201 | ENST00000603349 | 851 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC080078.1-201 | ENST00000603643 | 410 nt | TSL 3 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090425.2-201 | ENST00000608818 | 501 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DLEU1_2.1-201 | ENST00000617920 | 342 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC116096.1-201 | ENST00000566804 | 2314 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ASPN-201 | ENST00000375543 | 2237 nt | TSL 2 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL049780.3-201 | ENST00000624612 | 1583 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OLFM3-206 | ENST00000536598 | 2801 nt | TSL 5 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP295-201 | ENST00000362655 | 121 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-859P-201 | ENST00000362728 | 107 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1249P-201 | ENST00000363237 | 111 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U3.6-201 | ENST00000363622 | 211 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-75P-201 | ENST00000364621 | 146 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CRP-202 | ENST00000368110 | 667 nt | TSL 3 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-629P-201 | ENST00000384061 | 103 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR34A-201 | ENST00000385130 | 110 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF705D-201 | ENST00000400078 | 925 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP284-201 | ENST00000411002 | 343 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP142-201 | ENST00000411236 | 328 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MYO16-AS2-201 | ENST00000412809 | 436 nt | TSL 3 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL022329.2-201 | ENST00000413494 | 660 nt | TSL 5 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB1P11-201 | ENST00000413899 | 637 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS7P13-201 | ENST00000413955 | 498 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC245054.2-201 | ENST00000415639 | 319 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MORF4L1P6-201 | ENST00000418771 | 268 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS15AP6-201 | ENST00000420703 | 385 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004946.1-201 | ENST00000421825 | 751 nt | TSL 3 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MED14P1-201 | ENST00000430517 | 648 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARL5AP4-201 | ENST00000430731 | 512 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104653.2-201 | ENST00000435407 | 416 nt | TSL 3 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TXNP1-201 | ENST00000441872 | 371 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO1P19-201 | ENST00000443487 | 500 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00529-201 | ENST00000443854 | 241 nt | TSL 2 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009961.3-201 | ENST00000449832 | 765 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAP1BP2-201 | ENST00000478270 | 544 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL31P13-201 | ENST00000484151 | 370 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM172BP-201 | ENST00000487497 | 1089 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092666.1-201 | ENST00000492054 | 573 nt | TSL 4 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | COX7A2P2-201 | ENST00000505291 | 250 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02379-201 | ENST00000505741 | 300 nt | TSL 3 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010424.1-201 | ENST00000506336 | 297 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC113383.1-204 | ENST00000507060 | 552 nt | TSL 3 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091965.2-201 | ENST00000512324 | 613 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010265.1-201 | ENST00000513509 | 211 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |