Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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