Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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