Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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