Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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