Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
NISCHQ9Y2I1 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
NISCHQ9Y2I1 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NISCHQ9Y2I1 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms