Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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LTBP3Q9NS15 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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LTBP3Q9NS15 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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LTBP3Q9NS15 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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LTBP3Q9NS15 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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