Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
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GOPCQ9HD26 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GOPCQ9HD26 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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