Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TMX3Q96JJ7 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms