Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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