Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 SPATA8-AS1-202ENST00000560888 392 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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