Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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