Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms