Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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ECM1Q16610 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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ECM1Q16610 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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