Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms