Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN9AQ15858 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
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SCN9AQ15858 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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SCN9AQ15858 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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SCN9AQ15858 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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SCN9AQ15858 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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SCN9AQ15858 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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