Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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