Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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BRD3Q15059 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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BRD3Q15059 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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BRD3Q15059 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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BRD3Q15059 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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BRD3Q15059 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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BRD3Q15059 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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BRD3Q15059 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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