Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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HERPUD1Q15011 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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HERPUD1Q15011 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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HERPUD1Q15011 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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HERPUD1Q15011 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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HERPUD1Q15011 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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HERPUD1Q15011 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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