Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms