Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms