Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms