Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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