Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CUL3Q13618 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms