Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
IRF5Q13568 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms