Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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BFSP2Q13515 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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BFSP2Q13515 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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BFSP2Q13515 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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BFSP2Q13515 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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BFSP2Q13515 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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BFSP2Q13515 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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BFSP2Q13515 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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BFSP2Q13515 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
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BFSP2Q13515 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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BFSP2Q13515 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BFSP2Q13515 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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