Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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