Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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CHAF1BQ13112 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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CHAF1BQ13112 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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CHAF1BQ13112 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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CHAF1BQ13112 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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