Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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TRAF1Q13077 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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TRAF1Q13077 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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TRAF1Q13077 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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TRAF1Q13077 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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TRAF1Q13077 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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TRAF1Q13077 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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