Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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