Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms