Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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HCN4Q9Y3Q4 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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HCN4Q9Y3Q4 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
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HCN4Q9Y3Q4 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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HCN4Q9Y3Q4 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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HCN4Q9Y3Q4 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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HCN4Q9Y3Q4 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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HCN4Q9Y3Q4 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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HCN4Q9Y3Q4 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
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HCN4Q9Y3Q4 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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