Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SHOC2Q9UQ13 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms