Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms