Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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RTL8BQ17RB0 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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RTL8BQ17RB0 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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RTL8BQ17RB0 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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RTL8BQ17RB0 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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RTL8BQ17RB0 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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RTL8BQ17RB0 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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