Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PCSK7Q16549 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms