Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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RPE65Q16518 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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RPE65Q16518 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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RPE65Q16518 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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RPE65Q16518 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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RPE65Q16518 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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RPE65Q16518 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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