Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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