Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms