Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPAQ15257 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms