Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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