Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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