Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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CHD4Q14839 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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CHD4Q14839 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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CHD4Q14839 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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