Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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CCINQ13939 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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CCINQ13939 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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CCINQ13939 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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CCINQ13939 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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CCINQ13939 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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CCINQ13939 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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CCINQ13939 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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CCINQ13939 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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CCINQ13939 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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CCINQ13939 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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