Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RAPSNQ13702 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms