Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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