Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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PDE3BQ13370 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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