Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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