Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
GRIN2BQ13224 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms