Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NR1H3Q13133 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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